La réhabilitation du site s’appuie sur la conservation de la structure existante, construite dans les années 1950 par les architectes Louis Arretche et Roger Hummel, pour créer le futur Musée maritime de Saint-Malo appelé « l’Hydro ». Ce projet s’attache à préserver l’identité et l’héritage historique de l’édifice tout en y intégrant des espaces modernes dédiés à un musée contemporain. La reconversion comprendra des espaces d'exposition permanents et temporaires, ainsi que des zones de médiation et de sensibilisation aux enjeux maritimes, à travers des collections historiques, des objets découverts lors de fouilles sous-marines, et des expositions pédagogiques.
Le projet de l’agence Philippe Prost inclut des interventions contemporaines sur l’édifice existant, telles que des extensions et la création de nouveaux volumes. Ces ajouts sont conçus pour compléter l'architecture d'origine, comme la chapelle, inscrite aux Monuments historiques, qui sera préservée, intégrant ainsi une dimension patrimoniale importante dans le projet.
La réhabilitation prendra également en compte des critères de performance énergétique, dans le respect des normes en vigueur, afin d'assurer une gestion optimisée de l'énergie au sein du futur musée. L'utilisation de matériaux durables, sélectionnés pour leurs qualités environnementales et leur capacité à s'intégrer harmonieusement à l'édifice, viendra compléter cette démarche.
Le projet de transformation de l’ENSM en musée maritime est prévu pour être livré en 2028 et vise principalement à dynamiser l’offre culturelle et touristique de Saint-Malo tout en valorisant son patrimoine maritime.
